北京生命科学研究院08年Cell文章

【字体: 时间:2009年02月23日 来源:生物通

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生物通报道:

戚益军《细胞》再度解析RNAi

来自霍德华休斯医学院,沃森生物科学学院(Watson School of Biological Sciences,生物通注)冷泉港实验室,北京生命科学研究所NIBS的研究人员以模式生物拟南芥作为研究对象,针对拟南芥中Argonaute(简称AGO)复合物结合小RNAs分类的问题展开研究,发现了其分类的规律,说明了小RNA的序列在AGO复合物分类中的重要作用,为进一步研究RNAi过程提供了重要信息,这一研究成果公布在《Cell》杂志上。

领导这一研究的是北京生命科学研究所研究员戚益军博士,其早年毕业于南京农业大学植物病理学系,之后曾在美国俄亥俄州立大学,以及冷泉港实验室进行博士后研究。在2006年一篇发表于《Nature》的文章上,他与王秀杰教授证明了AGO4能够于包括源自转位因子和重复性元件的siRNA(小干扰RNA)在内的小RNA结合,并且降解靶标RNA转录本。

ARGONAUTE4 (AGO4)是一种在反向重复序列引发的RNA指导的DENA甲基化过程中的关键因子, 研究发现AGO4的Asp-Asp-His催化motif中的单个突变不会影响siRNA结合活性,但是能够消除掉它的催化能力。siRNA的聚集和在一些基因座上非CpG DNA甲基化需要AGO4催化活性,但是其他位点上的这些过程则对这种活性依赖较少。他们这项研究的结果与一个特殊的模型研究结果相一致——AGO4能够通过两种不同的、独立的机制在靶标基因座上起作用,除此之外AGO4也召集一些能够以一种不依赖它的催化活性的方式募集可以引发DNA甲基化作用的成分,而AGO4的催化活性则对次级的siRNA的产生至关重要。

在这项研究结果的基础上,依然以拟南芥这一模式生物(拟南芥包含有10种AGO)作为实验对象,研究人员针对特异性AGO复合物中的小RNAs如何分类这一问题展开了研究,结果他们发现AGO2和AGO4倾向于带有5’末端腺苷,而与miRNAs结合的AGO1则对5’末端尿苷“情有独中”,AGO5选择小RNAs根据其是否由胞嘧啶起始。改变一个miRNA的末端核苷会导致不同的AGO复合物形成,并改变其生物学特性。

这些结果说明了小RNA的序列在AGO复合物分类中的重要作用,从而也说明AGO复合物的特异性可能与5’末端结合区域(与某些小RNA序列结合)修饰有关,这也许解释了miRNAs由尿苷起始的进化驱动力。


973项目《细胞》子刊发现特殊侵染机制

来自中国农业大学植物生理学与生物化学国家重点实验室(State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry),北京生命科学研究所NIBS,中科院遗传研究所,堪萨斯州立大学的研究人员报道了丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)效应蛋白AvrPto帮助细菌侵染植物的分子机理,并发现Pto-AvrPto和FLS2-AvrPto作用方式类似,表明Pto在进化上很可能模拟了受体激酶,作为一个假靶标吸引AvrPto,从而让植物获得抗病性。这一研究成果公布在《Current Biology》杂志上。

领导这一研究的是北京生命科学研究所的周俭民博士,第一作者为向婷婷(博士研究生),宗娜(博士后),和邹燕(北京生命科学研究所博士毕业)。其他参与此项工作的还有:吴勇,张杰(北京生命科学研究所博士毕业),邢维满(北京生命科学研究所博士毕业),李燕,堪撒斯州立大学的唐晓艳教授,中科院遗传发育所的朱立煌研究员和NIBS的柴继杰研究员。这项研究获得了科技部863和北京市科委的资助。

植物依赖包括FLS2和EFR在内的受体激酶感应细菌的入侵并激活免疫反应。这一研究工作发现,AvrPto进入植物细胞内后直接作用于FLS2和EFR等受体激酶,阻断信号传导,使植物丧失感受细菌的能力。而在某些抗病番茄中,AvrPto能被胞内蛋白激酶Pto识别,并激活另一条更为强烈的免疫反应通路。该文工作发现Pto-AvrPto和FLS2-AvrPto作用方式类似,表明Pto在进化上很可能模拟了受体激酶,作为一个假靶标吸引AvrPto,从而让植物获得抗病性。

王晓东08年《Cell》文章

2008年王晓东实验室在《Cell》上发表了题为“TNF-α Induces Two Distinct Caspase-8 Activation Pathways”的文章,阐述了TNF-α的新研究成果。


1975年,Carswell等发现经卡介苗注射或细菌内毒素感染的小鼠血清中含有一种可引起荷瘤动物的肿瘤组织出血坏死的物质,该物质对体外培养的多种肿瘤细胞株具有细胞毒作用,但对正常细胞无杀伤作用,并将这种物质命名为肿瘤坏死因子(tumour necrosis factor,TNF)。20世纪90年代末在欧美重新确认了TNF-α抗肿瘤的重要地位,掀起了TNF-α在肿瘤研究和肿瘤治疗中的新篇章。


时间进入21世纪,有关TNF的研究逐渐得到了深入,科学家们发现,哺乳动物细胞对于TNF-α的炎症反应会由于一种蛋白合成抑制剂:cycloheximide(或Smac mimetic)而转向细胞凋亡,而后者是一种Smac/Diablo蛋白的小分子类似物,但是这种类似物与TNF-α作用的途径至今还并不是十分清楚,在这篇文章中,王等就是揭示了这方面的奥秘:他们发现TNF-α能通过两个不同caspase-8活性途径诱导细胞凋亡。

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